Les scripts sont parfaitement compris et interprétés par les moteurs de recherche. L'apparence de la page est donc identique pour un visiteur classique et un robot d'exploration du site.
Si à une époque le JavaScript pouvait être pénalisant pour le référencement, ce n'est plus le cas actuellement.
La seule pénalisation qui reste incontestable réside dans les temps de chargement et de rendu des fichiers .JS
Google a officialisé en Juillet 2018 l'impact de la vitesse d'un site dans la version Speed Update de son moteur.
Des scripts trop nombreux et mal positionnés peuvent entraîner des pénalités.